Все моды крайне рекомендую качать с SteamWorkshop через загрузчики в виде SteamCMD гайды есть в сети.
После скачивания модов(*.pak файлы) закидываем их в папку ConanSandbox/Mods/ и прописываем в правильном(у всех модов обычно есть рекомендации) порядке в файл modlist.txt
После установки,сервер/клиент необходимо перезапустить.
Так же можно иметь одну папку модов для сервера и клиента просто прописывая в файле ConanSandbox/Mods/modlist.txt путь к модам формата
*Путь к папке мода/modname.pak
Так же если у вас возникают проблемы с настройкой сервера,можно использовать Conan Exiles Dedicated Server Launcher
Его настройка требует некоторых знаний английского и понимания что мы делаем.
В идеале после того как он скачает сервер,убрать все галки автоматического обновления,и залить в его папку наш сервер(т.к в нем есть свои поправки)